南京医科大学康复医学系与省内外多家著名医学院校有着良好的合作交流关系，如广州中山大学、四川大学等，学系现有十余家安排本校康复治疗专业学生实习的医院，基本均为三级甲等医院，有着雄厚的校外学习资源，以下医院均为我学系学生的实习医院（排名不分先后）：

1、部属北京中日友好医院

2、四川大学附属华西医院

3、中南大学附属湘雅二医院

4、广州工伤康复医院

5、上海复旦大学附属华山医院

6、上海市第一人民医院

7、上海阳光康复中心

8、 南京医科大学第一附属医院

9、 南京医科大学第二附属医院

10、南京医科大学附属逸夫医院

11、南京医科大学附属南京医院

12、南京医科大学附属江宁医院

13、南京医科大学附属妇产医院

14、南京医科大学附属儿童医院

15、南京明基医院

16、南京医科大学附属无锡精神卫生中心

17、南京医科大学附属江苏盛泽医院

18、南京医科大学附属苏州科技城医院

19、南京医科大学附属淮安第一医院

20、东南大学附属中大医院

21、南京大学附属鼓楼医院

22、无锡同仁康复医院

23、宜兴九如城康复医院

24、苏北人民医院

25、徐州市中心医院

26、徐州医科大学附属医院